車輛登記證書的編號位于機動車登記證編號欄，即位于機動車登記證書第一頁右上角的條形碼下方。需要注意的是，機動車登記證書并非機動車行駛證，盡管它們的封皮顏色相同，都是綠色的，但大小不同，需要進行區分。