在替換發動機的時候，首先要注意發動機的相關手續是否完備，是否有合格證，并且需要確保包裝完好，并且包裝上的標識清晰可辨。一般情況下，替換發動機需要前往車管所進行相應的變更手續，新的發動機號碼應當被記錄在案。通常情況下打上原有發動機號碼是因為缺少合格證或是因為想避免繁瑣的手續，但是這是不允許的，如果在驗車時被發現，將無法進行驗車。在替換完成后，應該檢查好發動機線束和管路的布置是否整齊有序，并遵循新車磨合標準進行磨合。

一般情況下，替換發動機需要由4S店的工作人員來幫助變更行駛證上的新發動機號碼。在替換發動機時，一定要仔細檢查合格證的真實性，并且如果有可能的話辨認一下新發動機的來源。至于其他方面的補償，需要與4S店協商解決。

根據《中華人民共和國機動車登記辦法》的規定，機動車的發動機是不能隨意更換的。未經規定更換的發動機可能沒有經過嚴格的檢測或者本身就是報廢的機器，其安全性能會大大降低，從而增加安全隱患。