北京地鐵13號線、昌平線和19號線支線都會經過清河站，這是一座地面二層島式車站。清河站與京張高速鐵路、北京市郊鐵路S2線清河站位于同一線路上。清河站位于海淀區上清地區，站臺呈南北向布置。該站于2019年12月30日開通運營，昌平線部分預計在2020年12月通車，19號線支線的通車日期尚未確定。

清河站的設立主要考慮到為京張高鐵等提供服務。根據《2018年北京市重點建設項目計劃》，清河站交通樞紐一期的建設工程于2018年開工，面積達到1.4萬平方米。