對方代墊運費應以以下方式進行記賬：借：材料采購。貸：其他應付款。其他應付款是用于核算企業應付及暫時收到的其他單位或個人款項的科目。具體包括：應付經營租入固定資產和包裝物的租金、職工未按期領取的工資、收取的包裝物押金等保證金、歸屬單位或個人的應付統籌退休金等款項以及其他應付暫收款項。為了對款項進行明細分類核算，該科目應根據應付及暫時收到款項的種類、單位或個人設置明細賬目。